Циркулирующие варианты SARS-CoV-2 на территории Российской Федерации в период с марта по апрель 2024 года

По данным НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева в рамках мониторинга генетической изменчивости возбудителя COVID-19 в период с 01 марта по 30 апреля 2024 года проанализировано 438 образцов (283 образца собраны в марте, 155 образцов - в апреле 2024 г.) из 29 субъектов Российской Федерации.

Установлено, что в марте и апреле 2024 года, как и в предыдущие 2 месяца доминирующей линией оставался JN.1 и его производные. С начала этого года JN.1 является наиболее распространенным вариантом SARS-CoV-2 во всем мире. JN.1 является потомком ВА.2.86 («Пирола»). В конце 2023 г. ВОЗ присвоила этому варианту статус «Вариант, представляющий интерес», а 26 апреля 2024 г. рекомендовала использовать линию JN.1 в качестве антигена при создании вакцин для профилактики коронавирусной инфекции. Проведенные ВОЗ анализ и моделирование показали, что обновленный состав вакцин может дополнительно повысить на 23-33% эффективность для предупреждения тяжелого течения заболевания.

Эволюция SARS-CoV-2 продолжается. В настоящее время четырем циркулирующим вариантам ВОЗ присвоила статус «Вариант под наблюдением»: КР.2, JN.1.7, JN.1.18 и КР.З.

Все эти сублинии представляют собой потомков линии JN.1 с мутациями в гене S.

Сублиния КР.2, зарегистрированная в начале января 2024 г., несет мутации, приводящие к заменам в белке S:R346T, S:F456L, S:V1104L. Эта сублиния была зарегистрирована в Санкт-Петербурге в марте 2024 г. в единичных количествах. Такие же мутации несут в себе ещё две сублинии (KS.1 и JN.1.16.1), выявленные в 9 регионах Российской Федерации (Санкт-Петербург, Кемеровская, Магаданская, Тюменская и Рязанская области, Республика Башкортостан, Республика Мордовия, Москва и Московская область) в марте и апреле текущего года. Данные мутанты получили также название «FLiRT» по первым буквам замен аминокислотных остатков белка S.

Наибольший интерес представляет сублиния КР.З, несущая мутации, приводящие к заменам аминокислотных остатков в белке S:F456L, S:Q493E, S:V1104L, и относящаяся к группе с названием «FLiQE». Данная мутантная сублиния является наиболее быстро растущей производной линии JN.1 и обладает максимальным потенциалом ухода от иммунного ответа.

Сублиния КР.З, впервые зарегистрированная 11.02.2024, к настоящему моменту не обнаружена на территории Российской Федерации.

Источник: ФГБУ «НИИ гриппа им. А.А. Смородинцева» Минздрава России